《政府采购法》和《招标投标法》两者调整的是不同的法律关系，有严格的区别。政府采购是政府改革财政支出管理、调节经济运行的一种基本制度，其着重点是要解决政府内部财政资金如何支出的问题，属于政府内部事务；而招标投标是业主率先提出工程采购的条件和要求，邀请众多投标人参加投标并按照规定格式从中选择交易对象的一种市场交易行为。
以下是它们之间的区别和适用范围。
从特点来看，主要有以下几方面：
一是资金来源的公共性。政府采购资金来源于纳税人的税收和政府公共服务费，因此在很大程度上，政府采购部门充当了管理人的职能。
二是非营利性。政府采购是非商业性、非营利性的购买行为，采购目的是通过购买物资等为政府部门提供消费品和向社会提供公共服务。
三是规范性。现代国家都制定了一整套较完善的政府采购法规和条例，政府的任何采购活动都必须按规定的形式进行并接受社会监督。
四是政策性。政府采购是政府施政行为的体现，也是政府落实方针政策的关键环节，政府的多项方针政策都可以通过政府采购来实现。政府采购制度已形成财政、审计、供应商和社会各方位参与的机制。这些与招标投标有着本质的区别，政府采购具有相对独立的运行和管理制度，以上特点是招标投标所不具备的。
政府采购和招标投标在法律规范上有着本质的不同，因为政府采购与招标投标活动分别属于两部不同的法律规范，其立法宗旨、目标、性质、实施主体、组织形式等方面是完全不同的。
《招标投标法》是1999年全国人大常委会专门制定的用于指导招标投标活动的程序法，《政府采购法》是2003年全国人大专门为规范政府采购行为制定的一部实体法。为何在《招标投标法》出台3年后，还要颁布实施《政府采购法》，其根本在于两部法律的主要内容、调整范围不同。
《招标投标法》主要是对招标的程序、内容进行规范，尽管该法也涉及政府采购，但仅限于通过招标投标方式所进行的采购，对于其他采购方式无法解决。因此，《招标投标法》只是有关招标方面的一部基本性法律，而非一部全面的政府采购法律。
《政府采购法》和《招标投标法》两者调整的是不同的法律关系，有严格的区别。政府采购是政府改革财政支出管理、调节经济运行的一种基本制度，其着重点是要解决政府内部财政资金如何支出的问题，属于政府内部事务；而招标投标是业主率先提出工程采购的条件和要求，邀请众多投标人参加投标并按照规定格式从中选择交易对象的一种市场交易行为。
1、法律界定的范围不同：政府采购涵盖了使用财政性资金的所有采购活动，包括货物、服务和工程。其中服务项目的采购又属政府采购独有，如会议定点、加油、保险、印刷等。招标投标范围只有建设工程和相关货物，不包含服务。
2、实施的主体不同：遵照《政府采购法》的规定，各级政府依法成立一个政府采购中心管理政府内部的采购事务，该中心是一个纯服务性机构，承担实施本级政府采购集中采购目录内的项目，其经费列入财政预算。根据政府采购的特殊性，大多数的省从实行政府采购制度伊始就设立了独立的采购中心。对招标投标而言，国家有关部门批准登记设立的各类建设工程招投标机构，其性质属于营利性企业，不是政府的内设机构，没有行政职能。
3、组织形式有区别：政府采购是由财政部门、政府采购中心、采购人、评标专家、供应商、监察、审计机关等多方共同参与采购工作，实行'采、管”分离，并接受纪检部门的全程监督，在程序、方式、人员等方面具有很强的规范性，以便更有利于实现“三公”原则和避免暗箱操作的制度。而招标投标是由业主单位加招标机构和投标企业，有时甚至是两方组织完成的采购活动。
4、资金保障不同：政府采购实行严格的预算管理，并有坚实的预算资金作为保障，由国库统一集中支付，减少了拨款环节，避免了资金流失占用和拖欠资金等弊端，维护了政府形象。而招投标不具有上述特点。
5、服务结果不同：政府采购中心作为政府内部的服务机构不收取任何费用，同时对政府采购资金的节余部分全部归财政，充分体现了反腐倡廉目的，这是招标投标企业所无法做到的。
6、工作职能不同：《政府采购法》从机构性质、工作任务等方面对集中采购机构职能做了明确规定。
《国务院办公厅转发财政部关于全面推进政府采购制度改革意见的通知》（国办发 [2003]74号）文件再次明确了集中采购机构的性质和作用，指出要“充分发挥集中采购机构在全面推进政府采购改革中的重要作用”，并对集中采购机构的行政职能做了进一步的明确规定：“集中采购机构要接受委托，认真组织实施政府集中采购目录中的项目采购，制订集中采购操作规程，负责集中采购业务人员的培训。”这既是法律法规的强制性规定，又是法律授予集中采购机构的重要职能。
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